Події розвиваються через 2 роки після початку п'ятирічної місії. Екіпаж зоряного корабля «Ентерпрайз», на чолі з капітаном Джеймсом Т. Кірком, були атаковані могутньою і небезпечною хвилею невідомих прибульців, які знищують корабель, залишаючи їх без всього на новій незвіданій планеті, де вони потрапляють в конфлікт з новим безжальним ворогом.
